Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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