Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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