Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SMCO1Q147U7 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SMCO1Q147U7 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SMCO1Q147U7 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SMCO1Q147U7 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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SMCO1Q147U7 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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