Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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