Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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MDC1Q14676 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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