Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms