Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SHROOM2Q13796 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SHROOM2Q13796 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SHROOM2Q13796 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SHROOM2Q13796 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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