Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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