Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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