Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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RPA4Q13156 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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RPA4Q13156 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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RPA4Q13156 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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RPA4Q13156 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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RPA4Q13156 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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