Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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