Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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