Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FOXO1Q12778 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FOXO1Q12778 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FOXO1Q12778 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FOXO1Q12778 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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