Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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