Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CENPEQ02224 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms