Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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