Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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