Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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