Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC96Q2M329 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.7 ms