Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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