Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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