Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAMA3Q16787 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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