Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SGCAQ16586 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SGCAQ16586 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SGCAQ16586 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCAQ16586 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SGCAQ16586 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SGCAQ16586 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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