Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms