Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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