Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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BRD3Q15059 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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BRD3Q15059 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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BRD3Q15059 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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