Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CHD4Q14839 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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