Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms