Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PKP1Q13835 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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PKP1Q13835 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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PKP1Q13835 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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