Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHROOM2Q13796 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHROOM2Q13796 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms