Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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