Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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