Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CUL1Q13616 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CUL1Q13616 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CUL1Q13616 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CUL1Q13616 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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