Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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