Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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