Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATMQ13315 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATMQ13315 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATMQ13315 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATMQ13315 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms