Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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