Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms