Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms