Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms