Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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FOXF1Q12946 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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FOXF1Q12946 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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FOXF1Q12946 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF1Q12946 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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