Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
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CHD3Q12873 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
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CHD3Q12873 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CHD3Q12873 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CHD3Q12873 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CHD3Q12873 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD3Q12873 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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