Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms