Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms