Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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