Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms