Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms