Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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