Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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