Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLE3Q9NRF9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms